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黄博士的祖籍是浙江温州，1940年在四川重庆出生，童年时随父母东迁西逃，居无定所；直至1950年，才在台湾定居下来。聪明过人的黄小石10岁才正式入学，一开始就念五年级。
1958年，黄小石以优异的成绩被保送进入台湾大学，一心追寻真理的他，舍弃了医学系而选修了物理。当时在念大三的黄小石和他的同学们都觉得，信神的人没脑筋，科学时代还信神，说不过去！所以他们会说：“台大有位教法文和拉丁文的好老师，但在我们眼里美中不足的是，他相信上帝。”然而，第一次到老师家讨论科学与信仰问题时，这班自诩为天之骄子的高材生却变得哑口无言。
老师问：“人是不是单单由物质组成的？”
他们回答说：“当然啦，所有物质，包括人都是由原子组成。”
老师接着问：“那么我们身上的原子更换了，我们自己就不是原来的自己了吗？身体的原子随时都在更换，但就算全身的每个原子都换过了，自己还是没有改变，可见自我的成分不只是物质，还有一些物质之外的东西…还有，一个脑细胞是不会思想的，但为甚么一大堆脑细胞就会思想？”
老师的很多问题，学生们完全答不上来。
后来每个星期二，他们在老师家中，一边品尝美味点心，一边从科学角度去探讨上帝和信仰。就这样，这班学生和老师谈论了一年半，到毕业的时候，全部接受并肯定了上帝的存在。
黄博士认为，在那段时间里，谈得最多、影响他最深的，就是耶稣复活的可靠性和可行性：“最后，我也是从了解耶稣复活的史实中，接受祂的救恩。我看科学角度和寻索历史同出一理-溯本追源，耶稣其人其事，经当时的门徒及学者记录，无论是《圣经》或历史典籍都清楚明载。如果我们从历史考证的角度来求证史实，那么，耶稣是真实存在的。”他一语道破科学与基督信仰并无冲突的核心。他认为人一定能够在知识里面去寻求上帝、相信上帝。他自己就是一个极好的例子。
作为一个物理学家，他觉得，物理方式在信仰上是很好用的，一定不会信错。他确定科学并不否定神，反而是认知神存在的最佳明证。他说：“科学与基督信仰并无冲突，反而是相辅相成的，因为两者都有『要找出真理』的共同目的，只是寻找真理的方式不同—科学是透过逻辑与测量，但基督教所讲的爱、道德和灵魂等问题，却是要用信心去触摸。”
在黄博士的《上帝与物理》一书中，他提到爱因斯坦在1954年的一封信中曾经这样说：“没有宗教的科学是跛的，没有科学的宗教是瞎的。”宗教与科学若是一味相咬相吞、互不信任，迟早会造成一个又瘸又瞎的社会，既无力成就所渴慕的美善，又看不见自己的无知。黄博士则用他一贯幽默的风格写道：科学与宗教像许多的夫妻，他们个性非常不同，才干也不同，若彼此相争，可以比什么都尖锐，有说不尽的杀伤力，造成人间地狱；若彼此恩爱帮补，没有不能克服的困难，可以建立地上的天堂。
他的另一本书《实存的真相》，就是想告诉他的同事：跟你们一起做科学研究的我，怎么会当上传道人？当然，黄博士也希望引导每个人去深入思索：自然界背后的真相是什么？一些表象后面是什么？这一类的关系又是怎样？仔细考证后，你就会得到一个结论：它是从一位智慧者里面出来的！
法国著名数学家庞科伟说过：“房子是砖头盖的，真理是从事实出来的，但是一堆砖头并不是一间房子，知道一大堆事实不等于知道真理。”黄博士坚信，物理界、生物界、自然界的科学背后包含着一样隐藏的东西-上帝之手，其实一切都在述说神的存在和荣耀！
19世纪电学之父法拉第曾说过：“当我思想到自然界里有许多巨大的力量，每一种力量都足以毁灭人类的生存，但是这些力量却沉静地维持在一种巧妙的平衡之中。不仅没有危害人类，而且对人类的生活、经济活动有很大的助益。这样高智慧的设计，超过语言所能描述，我只能敬畏上帝的智慧。”
他又写道：“上帝已经给我们一个大自然，这是上帝要我们去学习的一所学校。成为一个科学家对时代是负有使命的，这使命就是用大自然的知识去训练人的心智，使人们培养出终生学习的习惯。希望大家不要误解，认为既然理智无法洞察未来，理智无法真正找到上帝，人就可以放弃自己应尽的责任；我不认为相信上帝的信心与相信一般事实的信心，有绝对的分别。我认为相信地上的事情和相信天上的事情，是一样的信心，很多人宁愿相信地上的，不肯相信那至高之处的美善，那是人性的软弱。籍着所造之物来认识看不见的上帝，籍着所造之物来认识背后的法则，这两种认识并不互相对立。”
可惜，许多思想家不但否定上帝的手，反而根据人间诸多的苦难、得出了“神不存在”的结论。很多人看到基督徒的难处，觉得神都不管那些诚心相信祂而同时却在受苦的人，认为上帝要么就不是全能，要么就不是慈爱的。
苦难，在人的生命中很不受欢迎，经常让人费解、替遭遇苦难的自己或者他人深觉不公。然而，上帝的独生子耶稣基督为了拯救人类灵魂而被钉死在十字架上的这个苦难（宇宙的君王默默地承受了人类残忍又屈辱的刑罚）更称得上是全天下最大的不公。
苦难的奥秘也许没有一个人可以用有限的智慧解释清楚，也成为很多人寻求信仰途中的阻碍。在黄小石博士看来，有时候苦难就如病痛，是对人发出一个警告，让人知道自己的渺小、知道自己无法掌控一切，它也能把人带到神的面前：哪怕就是当人在责怪神，也是人寻找神的开始。黄博士为了让人正确了解什么是爱和苦难，以及它们与信仰的关系，他也写成了《爱的真相》和《苦难的寻思》这两本书。
黄博士经常劝勉基督徒们，目光不要单单注目在苦难之上，我们短暂的生命也不只是停留在地上，我们当仰望那将要来的。他回忆自己在台湾当宪兵时，曾任少尉，夜里带队到屏东抓匪谍。当其他人进去搜妓院的时候，他坐在敞篷吉普车里等，又冷又黑。他记得自己当时唯一的盼望就是“盼天亮”，越等越有希望，因为天亮就可以回去！“现在看看我们真实的人生，如果只看外表，是一个慢慢丢掉盼望的过程。尤其人到中年以后，无论体力、能力、心力都不断在衰退，生命越来越接近死亡，看上去是越来越没有盼望的。然而，上帝却让我们无论身处甚么境况都有盼望—等天亮的盼望、满有把握的盼望，活生生的、越来越明亮的盼望。”
黄博士不但在信仰中里确实满有盼望，也满有预备。74岁的时候，他立下心愿：“主若给我时间，我计划写20本书。”于是，从2004年开始，他已经出版了《真理的追寻》《苦难的寻思》《爱的真相》《信的真谛》《天河拾贝》《恩典的岁月》《上帝与物理》等11本书，如此渊博的学问功夫、如此丰富的生命经历、如此坚持的心志毅力，怎能不叫人折服！他以基督徒的诚实、物理学家的理性、科学家的严谨，在这一本又一本的著作中娓娓道出人们寻找智慧和真理的结果，就是耶稣基督。
我最近刚购买的《上帝与物理》这本书的背面写着黄博士的自述：
诗词，是我“首先思想的”，是我的喜好，
物理，是我“接着思想的”，是我的方法，
上帝，成了我“最后思想的”，直到如今，是我的向往。
感谢上帝，赐给我们这样一位智慧又谦卑的长者，愿我们在他的启发之下也能够好好思想一下：在这短暂的一生中，我们应当思想什么、应当向往什么、应当重视什么、应当追求什么……
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“爱的不朽传说”
